Жалпы білім беретін пәндер академиялық мектебінің құжаттарында оқу процесін келесі бағыттар бойынша ғылыми ұйымдастырудың негізгі теориялық және практикалық аспектілері көрсетіледі:
- оқу процесін жоспарлау, ұйымдастыру, басқару;
- оқу процесін оқу-әдістемелік қамтамасыз ету;
- жұмыстар мен қызметтердің жоғары сапасын қамтамасыз ету;
- студенттермен тәрбие жұмысы.
Мектеп білім беру сапасын арттыратын, оқу-әдістемелік және ұйымдастыру жұмысында оқытушылардың шығармашылық белсенділігін ынталандыратын жоғары оқу орындарын даярлау саласында оқу, оқу-әдістемелік, ғылыми-зерттеу қызметін ұйымдастырады, жүзеге асырады. Мектеп қойылған мақсатты келесі функцияларды орындау арқылы жүзеге асырады:
- Қайнар Академиясының сапа саласындағы саясатын іске асыру;
- Қайнар Академиясының СМЖ талаптарын орындау;
- Академия мен мектептердің сапа саласындағы мақсаттарын іске асыру:
- білім беру қызметтерінің өмірлік циклінің кезеңдерін іске асыру;
- ұйымдастырушылық басқару;
- ресурстарды басқару;
- білім беру қызметтері мен бөлімше қызметінің процестерін мониторингілеу, өлшеу, талдау және үнемі жақсарту.
Мектеп студенттердің жалпы мәдени деңгейін арттыруға, олардың белсенді өмірлік ұстанымын қалыптастыруға, әлеуметтік-гуманитарлық цикл пәндерінің білімін қолдана білуге ықпал етеді. Қойылған мақсаттарға қол жеткізу үшін мектептің ПОҚ жоғары ғылыми-әдістемелік деңгейде оқу қызметін ұйымдастырады, сабақтан тыс жұмыстың белсенді нысандарын пайдаланады (дөңгелек үстелдер, ғылыми-практикалық конференциялар, қала және облыс мұражайларына экскурсиялар, әдеби кештер және қызықты адамдармен кездесулер және т.б.). Бұл студенттердің ой-өрісін кеңейтуге мүмкіндік береді, оларды туған өлкенің тарихы мен мәдениетімен таныстыруға мүмкіндік береді. Мектеп эстетикалық мәдениеттің деңгейін арттыруға, этикет дағдыларын қалыптастыруға көп көңіл бөледі.
Академиялық мектептің оқытушылары мерзімді түрде шетелдік ғылыми тағылымдамадан өтеді. Тәрбие жұмысына қатысады, адамгершілік тәрбие мәселелеріне ерекше назар аударады. Студенттерді оқытуда олардың теориялық және практикалық білімдерін арттыруға тиісті талапшылдық пен қамқорлық көрсетеді.
Академиялық мектептің оқытушылары ҚР БҒМ ЖОО студенттеріне арналған көптеген оқулықтар мен монографиялардың, соның ішінде "Қазақстан тарихы", "Қазақстан тарихы" (2004, 2005, 2010-2016 жж.) авторлары болып табылады. Сондай-ақ "Жетісудың демографиялық тарихы (1867-1926 жж.)"ғылыми монографиясы.
